Penggunaan warna pada penerapan branding Universitas Amikom Yogyakarta mempunyai 1 warna primer dan 4 warna sekunder.
Warna primer digunakan untuk elemen-elemen visual inti dalam penerapan branding Universitas Amikom Yogyakarta. Setiap pengaplikasian warna wajib mengikuti standard code yang sudah disediakan disamping, hal tersebut bertujuan untuk terciptanya konsistensi warna.